Η αρχή της δικιάς μας ιστορίας γίνεται στις αρχές της δεκαετίας του 1990, όταν μια παρέα φίλων, μαθητών, φοιτητών και επιστημόνων, έχοντας κοινή αγάπη την παράδοση, ξεκίνησε μια πρώτη προσπάθεια για να την κρατήσουν ζωντανή ως χορευτικό τμήμα.

Η προσπάθεια αυτή αγκαλιάστηκε και στηρίχθηκε ουσιαστικά από την Ιερά Μητρόπολη Λαγκαδά, όπου λειτούργησε ως το «Χορευτικό Συγκρότημα Ιεράς Μητροπόλεως Λαγκαδά», υπό την καθοδήγηση του Αρχιμανδρίτη Θεοδόσιου Εμμανουήλ. Για περίπου μία δεκαετία, η τοπική Εκκλησία αποτέλεσε τον βασικό πυλώνα στήριξης, προσφέροντας συνέχεια και σταθερότητα στη δράση της ομάδας.

Χαρακτηριστικό στοιχείο εκείνης της περιόδου αποτέλεσε και το λάβαρο της ομάδας, ένα βελούδινο μπλε λάβαρο με χρυσοκέντητα γράμματα — που έφερε ως σύμβολο το «ΧΡ», ένα από τα πιο γνωστά χριστογράμματα της Ορθόδοξης παράδοσης, ενώ στο κέντρο, μέσα σε κύκλο, απεικονιζόταν το αστέρι της Βεργίνας, συνδέοντας συμβολικά την πίστη με την ιστορική ταυτότητα της Μακεδονίας.

Το 1997, με αφορμή ένα ταξίδι στη Ρουμανία, γεννήθηκε η ανάγκη για μια πιο σαφή ταυτότητα. Τότε η ομάδα απέκτησε το όνομα «Μύγδωνες», συνδέοντας το παρόν με την ιστορία του τόπου.

Η φυσική εξέλιξη αυτής της πορείας ήρθε το 2000, όταν η ομάδα απέκτησε νομική υπόσταση και ιδρύθηκε επίσημα ο Πολιτιστικός Οργανισμός «Μυγδονία» Λαγκαδά. Μαζί με την ίδρυση, συντάχθηκε και το πρώτο καταστατικό, θέτοντας τις βάσεις για μια οργανωμένη και μακρόπνοη πορεία.

Τον Οκτώβριο του 2001, με αφορμή τη συμμετοχή σε φεστιβάλ στην πόλη Strzegom της Πολωνίας, πραγματοποιήθηκαν οι πρώτες εκλογές του οργανισμού. Πρώτος πρόεδρος εξελέγη ο Στυλιανός Καραγιοβάνης, ενώ καθήκοντα χοροδιδασκάλου ανέλαβε ο Αθανάσιος Καραθεοδώρου, τα οποία διατελεί μέχρι και σήμερα.

Από τότε μέχρι σήμερα, η Μυγδονία εξελίχθηκε σε έναν ζωντανό πυρήνα πολιτισμού, με περισσότερα από 200 ενεργά μέλη όλων των ηλικιών.

Τα χορευτικά τμήματα — παιδικά, εφηβικά, αρχαρίων, ενηλίκων και η ομάδα παραστάσεων — αποτελούν τον βασικό κορμό της δράσης της, διατηρώντας ζωντανή τη λαϊκή παράδοση μέσα από τη συνεχή συμμετοχή και δημιουργία.

Με σεβασμό στην αυθεντικότητα και μέσα από συστηματική έρευνα, διδάσκονται και παρουσιάζονται χοροί, τραγούδια και έθιμα από όλη την Ελλάδα, ενώ ο οργανισμός διαθέτει και μια πλούσια συλλογή παραδοσιακών φορεσιών και κοσμημάτων, τόσο αυθεντικών όσο και πιστών αντιγράφων.